Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATMQ13315 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATMQ13315 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATMQ13315 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATMQ13315 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATMQ13315 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATMQ13315 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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