Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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