Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.78□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRIM28Q13263 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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