Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SRSF6Q13247 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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