Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIN2BQ13224 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms