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| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-1068P-201 | ENST00000410958 | 103 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL117337.1-201 | ENST00000412789 | 444 nt | TSL 3 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | BX682237.1-201 | ENST00000415016 | 335 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
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| PTP4A2 | Q12974 | MCF2-208 | ENST00000519895 | 3346 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.93 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | KLRA1P-202 | ENST00000510134 | 1410 nt | TSL 5 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | OR5AK2-201 | ENST00000326855 | 996 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR26A1-201 | ENST00000362205 | 77 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
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| PTP4A2 | Q12974 | RNA5SP219-201 | ENST00000390940 | 113 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU2-3P-201 | ENST00000410144 | 191 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | CYCSP33-201 | ENST00000414485 | 327 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC003092.1-201 | ENST00000415536 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SAR1AP4-201 | ENST00000429225 | 591 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL365400.1-201 | ENST00000431854 | 640 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
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| PTP4A2 | Q12974 | AL138976.2-201 | ENST00000563989 | 694 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AF001550.1-201 | ENST00000572747 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC010620.2-201 | ENST00000600135 | 313 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AP003465.2-201 | ENST00000602571 | 373 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL162274.2-201 | ENST00000614406 | 332 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | DDX6-206 | ENST00000534980 | 4538 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | CHD9-203 | ENST00000447540 | 11509 nt | TSL 5 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | PIK3C2G-202 | ENST00000433979 | 4840 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | NBPF20-202 | ENST00000392971 | 18450 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | OR2J3-203 | ENST00000641960 | 3342 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SPAG11A-202 | ENST00000326625 | 445 nt | TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.38-201 | ENST00000362617 | 102 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-1303P-201 | ENST00000364841 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-38P-201 | ENST00000384085 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-748P-201 | ENST00000384648 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR634-201 | ENST00000385208 | 97 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | TRAJ21-201 | ENST00000390516 | 55 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | EEF1A1P41-201 | ENST00000414667 | 207 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNRPEP10-201 | ENST00000420249 | 274 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-333P-201 | ENST00000459117 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC092989.1-201 | ENST00000481235 | 277 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC103975.1-201 | ENST00000482506 | 483 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AKIRIN2P1-201 | ENST00000505898 | 352 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | HIGD1AP13-201 | ENST00000509878 | 289 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC011352.1-201 | ENST00000512300 | 793 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | UQCRB-202 | ENST00000517523 | 515 nt | TSL 2 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC069120.1-201 | ENST00000521623 | 379 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC124657.1-201 | ENST00000527819 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MRPL51-203 | ENST00000538814 | 501 nt | TSL 2 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | LINC02328-203 | ENST00000557195 | 682 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL049775.2-201 | ENST00000557547 | 558 nt | TSL 4 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | C8orf59-212 | ENST00000615697 | 483 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR3688-2-201 | ENST00000636963 | 87 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | C20orf24-208 | ENST00000639924 | 351 nt | TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MTND4P5-201 | ENST00000435821 | 1374 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | CUL3-203 | ENST00000409096 | 2701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | PHF3-202 | ENST00000393387 | 6947 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | LCOR-205 | ENST00000421806 | 16004 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MT-ND4L-201 | ENST00000361335 | 297 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.89-201 | ENST00000363031 | 102 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.231-201 | ENST00000364358 | 102 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.295-201 | ENST00000364918 | 102 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU1-140P-201 | ENST00000365040 | 165 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-1083P-201 | ENST00000384022 | 107 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Z92545.1-201 | ENST00000411782 | 234 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | POLHP1-201 | ENST00000411806 | 470 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RPL7P37-201 | ENST00000425095 | 738 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | LINC01626-201 | ENST00000431997 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MTATP6P13-201 | ENST00000438531 | 667 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC012445.1-201 | ENST00000442831 | 607 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | OXR1-205 | ENST00000442977 | 2956 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL135938.1-201 | ENST00000443141 | 297 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |