Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms