Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD10P28358 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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