Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZBED3Q96IU2 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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