Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
C18orf8Q96DM3 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
C18orf8Q96DM3 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms