Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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