Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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KNOP1Q1ED39 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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KNOP1Q1ED39 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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