Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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RTL8BQ17RB0 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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RTL8BQ17RB0 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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RTL8BQ17RB0 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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RTL8BQ17RB0 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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RTL8BQ17RB0 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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RTL8BQ17RB0 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RTL8BQ17RB0 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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