Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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PTPROQ16827 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPROQ16827 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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