Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HIF1AQ16665 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HIF1AQ16665 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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