Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PKN1Q16512 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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