Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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EXT1Q16394 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
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EXT1Q16394 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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EXT1Q16394 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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EXT1Q16394 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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EXT1Q16394 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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EXT1Q16394 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EXT1Q16394 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
EXT1Q16394 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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EXT1Q16394 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EXT1Q16394 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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EXT1Q16394 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EXT1Q16394 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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EXT1Q16394 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
EXT1Q16394 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EXT1Q16394 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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EXT1Q16394 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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EXT1Q16394 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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EXT1Q16394 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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EXT1Q16394 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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EXT1Q16394 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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EXT1Q16394 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EXT1Q16394 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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