Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZIC1Q15915 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms