Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
HERC1Q15751 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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