Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SHHQ15465 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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SHHQ15465 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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SHHQ15465 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SHHQ15465 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SHHQ15465 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SHHQ15465 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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