Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PCOLCEQ15113 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms