Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KARSQ15046 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KARSQ15046 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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