Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERPUD1Q15011 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERPUD1Q15011 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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