Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDE1CQ14123 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PDE1CQ14123 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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