Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SCARB2Q14108 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SCARB2Q14108 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCARB2Q14108 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCARB2Q14108 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCARB2Q14108 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCARB2Q14108 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCARB2Q14108 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCARB2Q14108 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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