Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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COL4A6Q14031 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
COL4A6Q14031 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.59□□□□□ -2.32
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COL4A6Q14031 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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COL4A6Q14031 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
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COL4A6Q14031 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
COL4A6Q14031 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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