Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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DDX39BQ13838 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DDX39BQ13838 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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