Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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ATP1A4Q13733 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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ATP1A4Q13733 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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ATP1A4Q13733 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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ATP1A4Q13733 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATP1A4Q13733 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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