Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1SQ13698 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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