Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CUL4BQ13620 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL4BQ13620 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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