Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEUROD1Q13562 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms