Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BFSP2Q13515 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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