Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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TUBB3Q13509 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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TUBB3Q13509 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TUBB3Q13509 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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