Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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