Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TCOF1Q13428 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TCOF1Q13428 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TCOF1Q13428 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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TCOF1Q13428 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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TCOF1Q13428 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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TCOF1Q13428 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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TCOF1Q13428 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TCOF1Q13428 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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