Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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SKP2Q13309 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SKP2Q13309 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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