Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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ERCC8Q13216 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ERCC8Q13216 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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