Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRDNQ13061 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms