Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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STRN3Q13033 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
STRN3Q13033 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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