Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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PRDM2Q13029 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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PRDM2Q13029 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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PRDM2Q13029 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PRDM2Q13029 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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