Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms