Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NPRL3Q12980 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms