Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXF2Q12947 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms