Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NUP160Q12769 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NUP160Q12769 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms