Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PGGT1BP53609 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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PGGT1BP53609 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PGGT1BP53609 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PGGT1BP53609 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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