Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD13P35453 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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