Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPREB1P12018 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms