Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LRRTM2O43300 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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