Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NRXN3Q9Y4C0 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NRXN3Q9Y4C0 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NRXN3Q9Y4C0 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NRXN3Q9Y4C0 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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NRXN3Q9Y4C0 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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NRXN3Q9Y4C0 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
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NRXN3Q9Y4C0 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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NRXN3Q9Y4C0 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
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NRXN3Q9Y4C0 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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NRXN3Q9Y4C0 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NRXN3Q9Y4C0 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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