Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NRXN1Q9ULB1 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NRXN1Q9ULB1 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms